В 2007 году Дмитрий Алексеев закончил МФТИ. С 2007-го занимается научной работой в НИИ физико-химической медицины. Под началом профессора Говоруна Вадима Марковича Дмитрию Алексееву удалось расширить группу биоинформатики с одного человека до 14. В 2012 году защитил кандидатскую диссертацию на тему «Разработка алгоритмов протеогеномного профилирования микроорганизмов». Заведуюет лабораторией биоинформатики НИИ ФХМ, с 2012 года читает курс «Введение в биоинформатику» для студентов 1–4 курсов МФТИ.